Die 110 Einzel- und 37 Doppelzimmer des Lazarus Hauses verteilen sich auf drei miteinander verbundene Häuser, die unterschiedlich gestaltet sind und verschiedene Schwerpunkte haben: Haus Sonneneck, Haus Boegehold und Haus Himmelslicht.
Der Haupteingang des Lazarus Hauses Berlin liegt im Haus Sonneneck. Besonderheit dieses Hauses ist das große, begrünte Atrium, durch dessen Glasdach sehr viel Tageslicht ins Hausinnere und auf die Flure der Wohngruppen gelangt. Im 1. und 2. Stock wohnen je 24 Bewohner auf einer Etage; im 3. Stock sind es 23 Bewohner. Bei der Modernisierung im Jahr 2013 wurden die Etagen so konzipiert, dass es immer zwei Küchen und zwei Gemeinschaftsräume gibt und dadurch kleinere Wohngruppen à 12 Personen entstehen. Die 3. Etage wurde zudem mit Klimaanlagen aufgerüstet, damit die Temperatur auch im Sommer angenehm ist. Im Erdgeschoss und Souterrain dieses Hauses befinden sich neben den Arztpraxen, dem Mauercafé und dem Friseursalon auch die Therapieräume und die Turnhalle der Physiotherapeuten.
Direkt an das sehr moderne Haus Sonneneck schließt der traditionelle Altbau des Hauses Boegehold. Besonderheit dieses Hauses ist die 150 Jahre alte Kapelle, zu der auch eine Orgel gehört. Hier finden regelmäßig Andachten und Gottesdienste statt. Im Haus Boegehold wohnen auf zwei Etagen je 24 und 25 Bewohner. Auf jeder Etage gibt es einen großen Gemeinschaftsbereich mit Blick auf den Garten, sowie kleinere, sehr hochwertig möblierte Sitzbereiche auf den Gängen. Im dritten Stock befindet sich außerdem das zur Stiftung Lobetal gehörende Lazarus Hospiz, welches über eine sehr schöne und große Dachterrasse verfügt.
Gehörlose Bewohner können sowohl im Haus Boegehold als auch im Haus Sonneneck wohnen. Die Pflegekräfte haben spezielle Schulungen durchlaufen und beherrschen zum Teil Gebärdensprache. Zudem gibt es verschiedene, speziell auf gehörlose Bewohner zugeschnittene Angebote und Besonderheiten, wie zum Beispiel Lichtblitzanlagen statt einer Klingel.
Das Haus Himmelslicht befindet sich etwas abseits und besteht aus zwei Demenz-Wohngruppen und einem Wohnbereich ohne Spezialisierung. Zudem wird in diesem Haus auf zwei Etagen Wohnen mit Service (Betreutes Wohnen) angeboten: In 12 Apartments und 3 Wohnungen. Der Gang ist auf jedem Wohnbereich als Rundgang angelegt. Neben zwei Gemeinschaftsräumen gibt es einige individuell gestaltete Sitzgelegenheiten auf den Fluren. Auch Tiere wohnen im Haus Himmelslicht: In der 3. Etage haben Wellensittiche und in der 4. Etage Hasen ihr Zuhause.
Eigene Haustiere dürfen nach Absprache mit ins Lazarus Haus Berlin einziehen.
Das Rauchen ist in separaten Raucherzimmern in jedem Haus möglich. Zudem befindet sich auf jeder Etage ein kleiner Gemeinschaftsbalkon.
Gästezimmer werden im Lazarus Gästehaus, welches sich direkt auf dem Gelände befindet, gegen ein Entgelt vermietet.